La discografía de Pixies incluye, hasta 2008, cinco álbumes de estudio, veinte sencillos, cinco recopilaciones y tres EPs. Esta lista no incluye los trabajos realizados por los miembros de Pixies en solitario.
Después de The Purple Tape, demo que grabaron en 1987 la banda firmó contrato con la compañía independiente 4AD. Con ellos realizarían Come on Pilgrim, formado de ocho canciones de su cinta demo, en octubre de 1987. Su primer álbum de larga duración, Surfer Rosa, fue lanzado en 1988 por 4AD; para la distribución en Estados Unidos se llegó a un acuerdo con la compañía Rough Trade Records varios meses más tarde. Aun así, Surfer Rosa no recibió una distribución masiva en dicho país.
Pixies accedió a ser difundidos en los Estados Unidos por la compañía Elektra Records antes de lanzar su tercer álbum de estudio , Doolittle. Fue el álbum más exitoso en la carrera de Pixies, alcanzando certificación de disco de oro por la RIAA en 1995 (sus únicas certificaciones, junto a la de Surfer Rosa en 2005). Después de una pausa en 1989, el grupo se volvió a reunir para lanzar Bossanova en 1990 y Trompe le Monde en 1991, antes de su separación en 1993. Tras su reencuentro en 2004, Pixies lanzó en dicho año el sencillo "Bam Thwok" y el cover "Ain't That Pretty At All" y posteriormente el álbum Indie Cindy en 2014.
Existen dos canciones de Pixies que nunca han sido lanzadas
"Watch What You're Doing". Versión de Pixies de la canción de Larry Norman que fue grabada en su cinta demo The Purple Tape, pero que nunca fue lanzada. Gary Smith comentó en 2004 que él había descubierto la cinta de la canción sentándose en un anaquel de mi casa.[12]
"Boom Chick A Boom". Grabada a principios de la carrera de la banda. La única interpretación grabada conocida fue hecha durante una transmisión de radio en la Universidad de Lowell en diciembre de 1986.[13]
Contiene un documental acerca de la influencia del grupo, videos de sus primeros conciertos, sus videos musicales y material de su gira de reunión del 2004.